竞价托管存在的第一个问题是缺乏透明度。参与竞价托管的广告主往往并不清楚他们的广告出现在哪些网站上，也不清楚自己的广告主要支付多少费用。这种缺乏透明度容易导致广告主无法有效评估广告效果的同时也无法确认广告的价值。此外，缺乏透明度也会增加广告主被欺诈行为所利用的风险，可能会导致广告主的投资浪费。
其次，竞价托管存在的第二个问题是点击欺诈。点击欺诈是指某些不端的操作会导致广告主的广告被虚假点击，从而让广告主产生不必要的广告费用。点击欺诈可能是由恶意竞争对手、网络机器人或不端网站等因素造成的。竞价托管广告往往是基于点击付费的模式，因此点击欺诈对广告主来说是一个严重的问题，可能导致他们花费大量资金却得不到相应的效果。
最后，竞价托管存在的第三个问题是竞争激烈导致成本上升。在竞价托管平台上，广告主之间为了抢占有限的广告位展开激烈竞争，这往往会导致关键词的竞价价格不断攀升。随着竞价价格的上升，广告主需要投入更多的资金才能保证自己的广告能够被展示在用户面前。这种竞争导致的成本上升给广告主带来了更大的经济压力，也增加了他们在广告竞价中的不确定性。